@Blucher : ta question est plus compliquée qu'elle n'en a l'air en réalité ... je rejoins Denis mais je vais t'apporter quelques précisions ...
Tout d'abord il y a eu le décret de 1797 qui a fixé le nombre de drapeaux à un par bataillon et a unifié leur design, jusque la on trouvait encore deux drapeaux dans certains régiments à la mode Ancien Régime (Drapeau Colonel et Drapeau National) comme chez les autres nations européennes mais on trouvait surtout de tout et n'importe quoi. Les Aigles sont créées en 1804 et distribués par l'Empereur lui-même, chaque unité recevant son emblème devant prêter un serment solennel de le défendre. Pour l'infanterie en théorie chaque bataillon a reçu une aigle (560 aigles distribuées en 1804) mais seul le 1er bataillon de chaque régiment était autorisé à l'arborer au combat, les autres restant dans les dépôts. A noter que les Aigles n'étaient pas forcément portées sur les hampes portant les drapeaux, elles pouvaient être portées séparément, dans tous les cas les aigles étaient beaucoup plus importantes que les drapeaux eux-mêmes. Ces pratiques sont restées identiques lors des réformes suivantes concernant les drapeaux (presque une par an).
Bien entendu il y a les nombreuses exceptions comme par exemple la jeune garde qui n'a jamais perçu d'aigles ou les régiments d'Espagne (principalement la cavalerie et la moité de l'infanterie) qui ont dû renvoyer leurs aigles au dépôts en 1813 pour les préserver ... D'une manière générale tout était fait pour réduire le nombre d'Aigles au sein des unités, en Décembre 1811 il est décrété que seuls les corps d'infanterie d'au moins 1200 hommes devait conserver leurs Aigles et les Aigles en trop ont été renvoyés au Ministère de la Guerre en Avril 1812 (certaines unités ont ignoré cet ordre ...). En Août 1811 on comptait 531 Aigles pour seulement 206 à la fin de l'Empire ...
Au sein des bataillons ce sont des fanions qui sont portés à l'échelle de la compagnie, normalement lorsque les compagnies d'Elite sont détachées elles n'ont que leur fanion, pas de drapeau.
Exemple de fanion :
Bref c'est compliqué, ça dépend des périodes, des unités et il y a des exceptions ...
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(à ne pas perdre) 